辖民国期间为山面乡。

1949年5月后，以夏林头至泽基山岭为界，南称岭外，北名岭底，本乡居北，因名岭底乡，属清江；1956年2月撤并乡，岭外乡并入，仍称岭底乡，属乐清县；1956年8月，乐清县泥工培训学校调整，属虹桥；1958年公社化时成立岭底管理，属芙蓉公社；1961年管理撤销，成立岭底公社，属清江；1983年12月政社分社，改称岭底乡。

2011年乡镇泥工培训学校调整，将原有岭底乡合并设置芙蓉镇。

2015年12月重新设立岭底乡。