大慈岩镇现域，按南宋淳熙《严州图经》,清嘉庆《兰溪县志》记载，南宋淳熙年间（1174—1189）为寿昌县仁丰乡,兰溪县瑞山乡属地；宋末推行都图制后，为寿昌县三都,四都和兰溪县二十一都,二十二都属地；清雍正六年（1728）为寿昌县排塘,大坞,吴山,陈店,常乐,麻车岗,下金,白下等庄，兰溪县玉华庄,仁塘庄属地。

1912年，属寿昌县常乐,兰溪县永昌,诸葛属地。

1932年，设置大慈乡。

1935年完成乡镇整顿后，为寿昌县梨山,慈云,狮砚乡和兰溪县华阳,瑞汇,仁砚乡属地。

解放前后，该地域为寿昌县大慈,狮山乡和兰溪县华南,诸葛,砚峰乡属地。

1950年划建小乡后，为寿昌县唐村,李村,陈店,里叶和兰溪县玉华,仁塘,翠屏乡（兰溪县3乡部分属地于1951年7月划属寿昌县）属地。

1956年并乡后，为唐村,新叶（1958年9月部分划属兰溪县）,里叶乡属地。

1958年底，属李村公社；1960年2月属寿昌公社。

1961年设置唐村（1981年9月改称檀村）,里叶两个公社。

1983年先后改乡。

1992年两乡合并组建檀村镇；2001年9月更称现名。