宋代为永丰乡栖鹤里，元,明照旧。

至清康熙十二年（1673），为江南永丰乡栖鹤里。

清光绪年间（1875—1908），为西南栖鹤十三庄（小臧村以北）,栖鹤十四庄（珠坑口以南）。

清宣统二年（1910），为景山乡南境，民国初承沿清制。

1935年，以横槎至上,下南坞为栖鹤一乡,山毛坞口东则为亲贤第一乡。

1944年，亲贤第一乡改名新化乡。

1946年10月4日，栖鹤一乡,栖鹤二乡,新化乡合并为栖鹤乡。

1950年，设下干乡（下干以西）,新华乡（小臧村以东）,栖鹤乡（梅洲以北）,石马乡（路西以南）。

1956年3月，栖鹤,下干,新华,石马四乡合并为湖源乡。

1958年10月，成立湖源公社。

1981年11月，湖源公社一分为三：析建湖源,窈口,栖鹤三公社，原栖鹤片之中溪,下溪,梅洲,寺口划入湖源公社。

1984年3月，撤社复称湖源乡,窈口乡，栖鹤乡。

2001年8月，窈口乡并入湖源乡。