新海镇由原新海,跃进,红星,长征四个市属国营农场合并而成。

新海农场原为开沙，于1948年涨成；1958年崇明县委统战部组织工商业者在开沙围地兴办新海畜牧场；1959年经上海市人民委员会批准围垦开沙，10月崇明县成立了围垦筹备委员会，下设开沙围垦指挥部，12月工程动工，历时半年建立国营崇明县新海农场；1961年起陆续接收上海市社会青年和知识青年；1963年7月农场改隶上海市农垦局，更名为上海市新海农场；1966年至1967年间曾称向阳农场；1968年7月恢复为上海市新海农场。

跃进农场原是新安沙；1960年9月上海市黄浦,吴淞,高教局三个单位围垦,筑江堤13千米，建造了吴淞水闸；1961年1月先后成立吴淞,黄浦,高教三个畜牧场；1963年10月三场合并建立了上海市新安沙农场；1964年秋冬又围垦新安沙的延伸部分（跃进沙9600亩）；1966年10月更名为上海市跃进农场。

红星农场原系芦苇滩涂，名曰“大同沙”；1960年9月由上海市普陀组织干部,职工围垦，1961年4月建立普陀畜牧场；1963年更名为洪西农场，11月与翌年4月长宁畜牧场和新海农场三个单位所属的一部分土地划归洪西农场；1966年秋改为红星农场。

长征农场前身为合隆沙；1960年9月由上海市长宁,徐汇,卢湾三个围垦，1961年4月分别建立畜牧场；1963年11月合并为合隆沙农场；1966年秋改名为上海市长征农场。

21世纪初为适应国家关于政企分设和市场经济体制改革的要求，原上海农工商（集团）总公司逐渐将下属的国营农场进行政企分设改革试点，2004年2月原新海,跃进,红星,长征四个农场的政务与管理职能进行整合归并，组建上海市新海地管理委员会。

2008年8月6日经上海市人民政府批准，由光明食品集团将新海地整建制移交崇明县属地管理，正式建镇，名称使用至今。