1929年属莒县第八和第一;1938年8月,中共莒县县委在小店岳家沟村建立,仍属第八。
1945年属青山和垛庄。
1947年,青山,垛庄两合并为第四。
1958年3月,北部为石井乡,南部为小店乡;9月,成立先锋公社。
1959年2月,改称小店公社。
1963年2月,将李官庄,山头渊,崮西等13个村划入,改称小店。
1971年,称小店公社。
1984年,改称小店乡。
1993年4月,小店,金墩同时撤乡,合并为小店镇。