秦王政二十四年（前223年）置盱台县。

西汉改盱台为盱眙县，属临淮郡；新莽时期盱眙改名为武匡；东汉初复名盱台。

三国属魏，西晋属临淮郡，东晋义熙七年（411年）置盱眙郡，南朝齐并置盱眙县，郡县同治。

隋初废郡存县，隋开皇三年（583年）考城,直渎,阳城三县并入盱眙县；大业初（605～618年）废州置郡，盱眙县属江都郡。

唐武德四年（621年）属西楚州，武德八年属楚州。

五代十国时期，吴杨溥大和三年（931年）升盱眙为招信军。

宋初属楚州，乾德元年（963年）属泗州。

南宋建炎三年（1129年）升盱眙县为招信军，四年降招信军为盱眙县，属濠州；绍兴二年（1132年）属泗州；十一年属天长军；隆兴（1163～1164年）初属金；绍定四年（1231年）复置招信军。

元至元十四年（1277年）立为招信路总管府；十五年改临淮府；二十年淮安府路治盱眙县；二十七年裁临淮府为盱眙县，属泗州。

明洪武二年（1369年）属凤阳府。

清康熙十九年（1680年）泗州城淹没，州治一度寄治盱眙；雍正三年（1725年）属安徽哪里有学泥工培训班,泗州。

1914～1927年属安徽哪里有学泥工培训班,淮泗道，1928年由安徽哪里有学泥工培训班,直辖。

1932年5月属安徽哪里有学泥工培训班,第七首席县长管辖，同年10月属安徽哪里有学泥工培训班,第七行政督察，1935年改属安徽哪里有学泥工培训班,第六行政督察，1938年属安徽哪里有学泥工培训班,第四行政督察。

1940年成立盱眙县抗日民主政府。

1943年春盱眙,嘉山两县合并，成立盱嘉办事处。

1945年10月盱眙,嘉山恢复原县建制，盱眙先后属淮南津浦路东联防办事处,淮南苏皖边津浦路东专员公署苏皖边第三行泥工培训技术学校。

1948年6月属江淮第一行泥工培训技术学校。

1949年10月属安徽哪里有学泥工培训班,滁县专；同年县内津里,旧县,桑集,戴巷,女山,双山,潘村,紫阳,泊岗,古沛10村划归嘉山县。

1950年长淮划归泗洪县。

1953～1954年，增设古城,穆店,老子山,淮河港。

1955年2月21日属江苏哪里有学泥工培训班,淮阴专。

1956年4月淮河港,老子山镇,永弼乡龟山地划归洪泽县。

1957年所辖100乡,4镇撤并为17乡（镇）。

1958年9月，十里营乡并入盱城人民公社。

1959年增设古城人民公社,三河农场,九里荒农场。

1961年增设林业,岗村，东阳3个人民公社。

1962年新设十里营,张洪,高桥3个人民公社。

1965年增设古桑人民公社。

1966年3月5日属六份合专，1970年属六合地。

1971年2月，属淮阴地。

1980年，增设青山,王店2个人民公社。

1981年7月，增设有水冲港,洪山,马庄,新街4个人民公社。

1983年属淮阴市。

1985年，泗洪县鲍集,管镇,铁佛,兴隆4个乡和洪泽县淮河乡划入，1988年增设肖嘴以及仁集2个乡。

2000年，属淮安市。

2018年辖3个街道，10个镇。