南集乡境在清代大部分隶属大飞镇，民国初属大飞市，1929年属第八，1934年后属第六。

抗日民主政权建立后，1942年11月建南集。

新中国成立后仍属南集，1956年2月撤销南集，改属黄营，1957年12月撤并乡时由守阳,道行及下营,范荡,六堡,顺集等乡的一部分组成南集乡，1958年8月成立南集人民公社，1983年6月，改称南集乡。

2000年初朱陈苗圃并入，改称南集镇。

10月全县实施撤乡并镇，北集乡并入南集镇。