明代分属兴文,岔曲,南王保。

清代西部属南王保和岔曲保，东北部属文兴保。

民国初年因之。

1921年属南。

1929年属第三。

1934年属第一，分设皇帝庙,吴集,小商桥,洪山庙,石佛陈等联保处。

1941年分属商桥镇,陈庄乡。

1948年属商桥。

1949年分属台陈,瓦店。

1956年设皇帝庙中心乡。

1958年成立皇帝庙公社。

1959年与王曲公社合并，属王曲公社。

1961年属台陈。

1962年从台陈划出，设立皇帝庙。

1965年复皇帝庙公社。

1984年改设皇帝庙乡。