清朝时期，大寺镇境域属钦州。

民国十九年（1930年），设大寺镇及大寺乡，属钦县。

民国三十年（1941年），合并为大寺乡。

1951年春，分设15个乡（镇）。

1957年7月，改属钦僮壮族自治县，分设大寺,附城,屯强,南间4个乡（镇）。

次年秋，4个乡（镇）并入大寺公社。

同年11月15日，改属钦县。

1959年4月，分设大寺公社。

1984年9月，大寺公社撤改为大寺镇。

1989年，大寺镇设18个村公所,1个居委会,72个村委会。