仁居古称“豪居”，秦汉时为揭阳县地，晋时属海阳县，齐以后归程乡县管辖。

明嘉靖四十一年（1562年）设置平远县时，始为县治所在地，直至1952年。

清末民国初期，豪居改称仁居。

民国三十二年（1943年），仁居属平远第一。

下设13保。

1949年5月，平远解放后，仁居为平远县第一。

1952年6月，平远,蕉岭合县，仁居属蕉岭县第五。

1954年3月，平远,蕉岭恢复县建制，仁居被划为平远县第一。

1957年，撤销建制设立仁居乡。

1958年9月，撤乡成立“政社合一”的人民公社，原仁居乡,差干乡,邹黄乡合并成立仁居人民公社。

1961年1月，邹坊,黄畲,差干从仁居公社分出，各自成立公社。

1963年3月，黄畲,邹坊,仁居合并为仁居公社。

1978年3月，黄畲从仁居分出。

1983年11月，撤销公社建制，设立仁居公所。

1986年11月，撤建乡（镇）时，设立仁居镇。