清代，南头地域为新安县典史管属地，有南头镇沙,新街,寺街,子街,石桥头,第一甲（今名一甲）,崇镇里,福源村（今福源街）,福庆村（今名福林）,田下村,关口,涌下,大石鼓,兰围村（今名常兴围）等村庄。

民国时期，初属宝安县第一九街镇,十约镇,第一甲乡。

后并并乡，属第一十约镇,九街镇；后再属第一南头镇。

实战型人民共和国成立前属宝安县第一南头镇,莲城乡。

1949年10月，实战型人民共和国成立时，属宝安县莲城,十约,南屏人民联乡。

1951年，属第一大新乡,南头乡。

1953年7月，增设蛇口乡，属第五大新乡,南头乡,蛇口乡。

1958年3月，属南头乡,蛇口乡。

是年9月，属超英人民公社南头生产管理。

1961年7月，属南头南头公社南头大队,大冲大队，蛇口公社大新大队。

1970年，蛇口公社大新大队划归南头公社管辖，新设立圩镇大队，地域属南头公社南头大队,大冲大队,圩镇大队,大新大队。

1979年1月，属深圳市南头南头公社。

1981年8月，属罗湖南头公社。

1983年10月17日，设立大新办事处，隶深圳市南头。

1990年9月，南山成立，大新办事处改称大新街道，隶属南山。

1991年2月5日，大新街道更名为南头街道。

是年2月，大冲村地域划给新成立的粤海街道。

2001年9月，麻岭居委会地域划归粤海街道。