明朝中叶（约1460年），福建莆田马,丁,洪等姓到此创村定居，称三湾村。

前属饶平县。

明嘉靖四十二年（1563）属澄海县苏湾都。

清康熙二十五年（1686）三湾村改称湾兴村。

1914年湾兴村析为南湾,北湾和东湾三乡。

1921年废都设，属苏南。

1946年南湾与北湾,东湾,渡亭合称湾渡乡。

1951年属海滨。

1953年属二。

1956年湾头片合称东湾乡。

1957年东湾乡改称湾头乡。

1958年成立澄海县人民公社，属第一支队，南湾与南份合称101团。

1959年南份析出，设南湾生产大队，属苏南人民公社。

1968年属东方红人民公社。

1972年属湾头人民公社。

1984年1月设建乡，南湾,南份合设南湾乡，属湾头。

1986年11月撤置镇，南份析出，设南湾村，属湾头镇。

1990年9月设南湾管理。

1999年6月设南湾村。

2002年属莲下镇，沿用至今。