东汉后，镇域曾名击头店,栗头店。

北宋时，易名为栎头镇。

明宣德年间又称栗头仓，明正德时又改叫栗店,栗头坡。

1949年后,镇域设有西刘公社,九龙公社，归原县级阜阳县华佗管辖，其中九龙公社原驻地龙王堂。

1975年8月，镇域遇洪水，将原九龙公社迁九龙沟附近。

1976年2月成立九龙公社。

1976年6月在九龙沟附近兴集，称为九龙集。

1979年建划社时，由原九龙公社划出北部8个大队建社，沿用九龙公社名称，隶属华佗。

1983年改称九龙乡。

乡政府驻地栗头店。

1989年2月，镇域成立九龙乡,西刘乡。

1992年1月撤并乡将九龙乡,西刘乡合并成立九龙镇。

1996年九龙镇辖16个村，即五坑,庙西,庙前,姬庙,南竹园,刘竹园,西刘,栗头,张庄,叶寨,陈桥,刘湾,李竹园,姚庄,龙王,温庄。

1999年1月，栗头村分为栗头村和九龙居委会，五坑村分为五坑村和老王营村，变为18个村。

2006年12月，村级划调整撤并为8个村委会和1个居民委员会，即原九龙居委会,张庄,栗头三村撤并为九龙居委会，原五坑,老王营二村撤并为五坑村，原庙前,庙西二村撤并为庙前村，原南竹园,刘竹园撤并为刘竹园村，原叶寨,陈桥二村撤并为叶寨村，原李竹园,刘湾二村撤并为李竹园村，原龙王,温庄,姚庄撤并为龙王，西刘和姬庙二村保留。

2010年九龙镇辖8个村委会和1个居委会。