1949年初属肥东县吴店吴店乡;1958年属埠里公社;1965年划归长丰县,由埠里公社划出成立吴店公社,为吴店公社吴店大队;1968年吴店公社并入罗集公社,吴店大队属之;1971年再置吴店公社,吴店大队属之;1983年体制改革,为吴店乡吴店村;1992年3月撤并乡,随吴店乡并入双墩镇,隶属双墩镇;后原上洼村的小魏庄,杨糖坊,上刘洼,下刘洼,倪岗,河洼,孙岗并入吴店村;2002年吴店村改为吴店,隶属双墩镇至今。